Pelaksanaan KKN STAI Natuna sudah dimulai sejak STAI Natuna menerjunkan Angkatan pertama pada tahun 2004 sampai dengan angkatan ke 13, telah banyak dirasakan manfaatnya bagi masyarakat di lokasi KKN. Khususnya pembangunan di bidang kehidupan beragama. Demikian pula, mahasiswa diharapkan mampu memetik manfaat dalam pengembangan potensi dirinya, mengaplikasikan teori yang sudah didapatkan di kampus. Begitu juga dengan STAI Natuna dapat mendapatkan masukan yang sangat berarti dalam upaya meningkatkan pengabdian kepada masyarakat sebagai salah satu dari Tri Dharma Perguruan Tinggi